停止php-fpm(apache同理):
sudo /png/php/7.0.0/png_fpm stop

创建opcode缓存目录:
mkdir -m 777 /png/php/opcache_file_cache

在php.ini中配置:
zend_extension=/png/php/7.0.0/lib/php/extensions/no-debug-non-zts-20151012/opcache.so
opcache.memory_consumption=128
opcache.interned_strings_buffer=8
opcache.max_accelerated_files=4000
;opcache不保存注释,减少opcode大小
opcache.save_comments=0
;关闭PHP文件时间戳验证
opcache.validate_timestamps=Off
;每60秒验证php文件时间戳是否更新
;opcache.revalidate_freq=60
opcache.fast_shutdown=1
;注意,PHP7下命令行执行的脚本也会被 opcache.file_cache 缓存.
opcache.enable_cli=1
;设置不缓存的黑名单
;opcache.blacklist_filename=/png/php/opcache_blacklist
opcache.file_cache=/png/php/opcache_file_cache
opcache.file_cache_only=0
opcache.enable=On

备份原来项目(以phpMyAdmin为例):
cp -R /png/www/example.com/public_html/app/pma /png/www/example.com/public_html/app/pma.bak

执行opcache_compile_file.php导出PHP脚本对应的opcode:
sudo /png/php/7.0.0/bin/php /png/www/example.com/public_html/app/opcache_compile_file.php
opcache_compile_file.php 内容如下:

<?php
function getfiles( $path , &$files = array() ) {
    if ( !is_dir( $path ) ) return null;
    $handle = opendir( $path );
    while ( false !== ( $file = readdir( $handle ) ) ) {
        if ( $file != '.' && $file != '..' ) {
            $path2 = $path . '/' . $file;
            if ( is_dir( $path2 ) ) {
                getfiles( $path2 , $files );
            } else {
                if ( preg_match( '%\.php$%' , $file ) ) {
                    $files[] = $path2;
                }
            }
        }
    }
    return $files;
}
// 获取指定目录及其子目录下的所有PHP文件
$files = getfiles('/png/www/example.com/public_html/app/pma');
foreach($files as $file){
    opcache_compile_file($file); //编译PHP文件生成opcode
    file_put_contents($file, ''); //清空原来的PHP脚本
    echo $file."\n";
}
echo 'Total PHP Files: '.count($files)."\n";

或者使用PHP的SPL库里提供的递归目录迭代器RecursiveDirectoryIterator实现递归编译PHP:

<?php
opcache_compile_files('/png/www/example.com/public_html/app/pma');
function opcache_compile_files($dir) {
    foreach(new RecursiveIteratorIterator(new RecursiveDirectoryIterator($dir)) as $v) {
        if(!$v->isDir() && preg_match('%\.php$%', $v->getRealPath())) {
            opcache_compile_file($v->getRealPath());
            echo $v->getRealPath()."\n";
        }
    }
}

把缓存目录所有者设为php-fpm运行用户,我这里是png:
sudo chown -R png:png /png/php/opcache_file_cache/

启动php-fpm:
sudo /png/php/7.0.0/png_fpm start
访问phpMyAdmin:
http://www.example.com/app/pma/

phpMyAdmin的PHP文件一一对应的opcode(后缀为.php.bin)生成在:
/png/php/opcache_file_cache/xxx/png/www/example.com/public_html/app/pma
其中xxx是一个32位的md5编码的字符串.
部署到目标服务器的时候,需要保留项目中内容被清空的PHP脚本.
而且路径一定要对应导出opcode时的路径,文中的就是:
/png/www/example.com/public_html/app/pma

另外,PHP还可以使用函数php_strip_whitespace()删除PHP源码中的注释和空格.

后话:
opcache.file_cache是PHP7对hhvm.repo.central.path的反击,鸟哥威武!
opcache.file_cache对比PHP5时代APC的apc_bin_dumpfile和apc_bin_loadfile来说,
导出和导入操作都由opcache完成,显然ZendOpcache比APC更加自动化.
那个md5串由 PHP_VERSION / ZEND_EXTENSION_BUILD_ID / ZEND_BIN_ID 确定:

php-src/ext/opcache/zend_file_cache.c: zend_file_cache_get_bin_file_path ZCG(system_id)
php-src/ext/opcache/ZendAccelerator.c: accel_gen_system_id ZCG(system_id) 
#define ZEND_EXTENSION_BUILD_ID "API" ZEND_TOSTR(ZEND_EXTENSION_API_NO) ZEND_BUILD_TS ZEND_BUILD_DEBUG ZEND_BUILD_SYSTEM ZEND_BUILD_EXTRA
#define ZEND_BIN_ID "BIN_" ZEND_TOSTR(SIZEOF_CHAR) ZEND_TOSTR(SIZEOF_INT) ZEND_TOSTR(SIZEOF_LONG) ZEND_TOSTR(SIZEOF_SIZE_T) ZEND_TOSTR(SIZEOF_ZEND_LONG) ZEND_TOSTR(ZEND_MM_ALIGNMENT)

因为Ubuntu上编译的PHP7,打包依赖库后放到CentOS上运行,这个md5串是相同的.
可以肯定的是,Linux上导出的opcode不能放到Windows上运行,反之也是如此.

Beast加密过的PHP文件,也一样能看到PHP文件对应的opcode,
因为Beast解密后,还是一样需要调用zend_compile_file生成页面的opcode,
而opcode是可以用VLD(Vulcan Logic Disassembler)这类PECL扩展查看的.
php -dvld.active=1 -S 127.0.0.1:8080
curl http://127.0.0.1:8080/
也就是说,PHP脚本加密能够避免脚本被恶意篡改,但脚本里的数据仍然是可见的.
所以,文中的opcache.file_cache用来保护代码逻辑应该还是可以的,
但不能确保里面定义的量的安全,比如加密密钥.存也可以,但防君子不防小人,门槛高点而已.

Zend Guard和ionCube加密的PHP脚本可以用DeZender/De-ionCube解密:
http://dezender.net/
Java字节码和Android APK可以用Java Decompiler反编译:
http://jd.benow.ca/
Python脚本可以编译成pyc文件,不过pyc文件也很容易被反编译.
所以包括opcache.file_cache这样的代码保护,也只能防君子不防小人.